Os orgão de Direcção e Gestão são:

Director Geral
Selemane David José, Ph.D. (Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Brasil, 2019)

Director-Geral Adjunto para Área de Administração e Finanças: 
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Director-Geral Adjunto para Área Académica
Belchior Coelho Miguel, Ph.D. (Universidade Nova de Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal, 2022)

A Direccção e Gestão do ISPT são exercidas pelos seguintes orgãos: 

a)  Conselho de Representantes 
b)  Director-Geral, 
c) Conselho Administrativo e de Gestão, 
d) Conselho Técnico e de Qualidade. 

O Conselho de Representantes é a estrutura superior de direcção do ISPT e tem a seguinte composição:

a) Presidente do Conselho de Representantes;

b) Director – Geral;

c) Directores das Divisões;

d) Directores dos Centros de Investigação Científica;

e) Directores dos Serviços Centrais;

f) Dois representantes do Corpo Docente;

g) Um representante do Corpo Técnico-Administrativo;

h) Um representante do Corpo Discente;

i) Seis representantes da sociedade civil local e regional, dos quais pelo menos quatro são provenientes da comunidade empresarial e das organizações profissionais dos sectores directamente ligados às áreas de ensino e formação ministradas no ISPT;

j) Um representante do Governo Provincial local indicado pelo respectivo Governador da Província;

k) Um representante do Ministério que superintende o sector do ensino superior indicado pelo respectivo Ministro.